El propósito de este trabajo fue la implementación de la propuesta metodológica de la Lista Roja de Ecosistemas de la UICN, con la finalidad de analizar y evaluar el estado actual y las vulnerabilidades de los ecosistemas de las serranías chiquitanas, en el Departamento de Santa Cruz, Bolivia. Se evaluaron 20 ecosistemas, entre terrestres y acuáticos, mediante un análisis de cuatro criterios y sus respectivos umbrales de severidad, para determinar si califican en alguna de las categorías de riesgo de colapso de la UICN. En el criterio A o de la reducción de la distribución se identificaron las tasas de cambio en periodos pasados (antes de 1570, posterior a 1986), presente (2016) y futuro (2046). En el criterio B o de distribución geográfica restringida se analizó la extensión de la ocupación (EOO) y área de ocupación (AOO) para el año 2016. En el criterio C o degradación ambiental, se evaluó el riesgo de erosión para los periodos 1986-2016 y 2016-2046. En el criterio C o alteración de procesos e interacciones bióticas se calculó los niveles de fragmentación (1986-2046), la degradación por quemas (1986-2016) y la pérdida del hábitat del jaguar (Panthera onca) (1986-2046). La aplicación de este marco analítico permitió identificar la existencia de seis ecosistemas en la categoría de En Peligro Crítico, 11 En Peligro, dos Vulnerable y uno de Menor Riesgo.